通过他们的“T-REX”步地,镶嵌在团员物中的DNA不错用于历久存储基因组或数字数据,如像片和音乐。
在电影《侏罗纪公园》(Jurassic Park)中,科学家们索要了保存在琥珀中数百万年的DNA,并用它创造了一个示寂已久的恐龙种群。
麻省理工学院的规划东谈主员在一定进度上受到了这部电影的启发,开辟出了一种玻璃状的琥珀状团员物,可用于历久存储DNA,不管是总共这个词东谈主类基因组一经像片等数字文献。
咫尺,大多数储存DNA的步地皆需要冰冻的温度,因此它们要消费大皆的能量,何况活着界上很多地点皆弗成行。比较之下,这种新的琥珀状团员物不错在室温下储存DNA,同期还能保护分子不受热或水的毁伤。
规划东谈主员暗示,他们不错使用这种团员物来存储编码《侏罗纪公园》主题音乐的DNA序列,以及总共这个词东谈主类基因组。他们还讲明,DNA不错很容易地从团员物中移除,而不会损坏团员物。
前麻省理工学院博士后詹姆斯·巴纳尔说:“冷冻DNA是保存它的首选步地,但十分不菲,何况弗成膨胀。我合计,咱们的新保存步地将成为一种可能鼓舞将来在DNA上存储数字信息的本事。”
巴纳尔和麻省理工学院A.Thomas Geurtin化学纯熟杰里米·约翰逊是这项规划的资深作家,这项规划昨天发表在《好意思国化学学会杂志》上。前麻省理工学院博士后伊丽莎白·普林斯和麻省理工学院博士后郑浩峰(音译)是这篇论文的主要作家。
获得DNA
DNA是一种十分踏实的分子,十分符合存储大皆信息,包括数字数据。数字存储系统将文本、像片和其他类型的信息编码为一系列0和1。相似的信息不错用构成遗传密码的四种核苷酸来编码:A、T、G和C。举例,G和C不错用来暗示0,而A和T代表1。
DNA提供了一种高密度存储这些数字信息的步地:表面上,一个装满DNA的咖啡杯不错存储宇宙上总共的数据。DNA也十分踏实,相对容易合成和排序。
2021年,巴纳尔和他的博士后导师、麻省理工学院生物工程纯熟马克·巴特(Mark Bathe)开辟了一种将DNA存储在二氧化硅颗粒中的步地,二氧化硅颗粒不错贴上标签,深化颗粒的本色。这项责任导致了一个名为“缓存DNA”的繁衍居品。
但这种存储系统的一个舛错是,将DNA镶嵌二氧化硅颗粒需要几天的时辰。此外,从颗粒中去除DNA需要氢氟酸,这对搞定DNA的操作主谈主员来说是危急的。
为了找到可替代的储存材料,巴纳尔启动与约翰逊偏抓本质室成员互助。他们的念念法是使用一种被称为可降解热固性团员物的团员物,这种团员物由加热后变成固体的团员物构成。这种材料还包括可切割的集聚,不错很容易地断裂,允许团员物以一种可控的面貌降解。
约翰逊说:“有了这些可明白的热固性材料,咱们不错凭据咱们放入的可切割键来聘任怎样降解它们。”
在这个神态中,规划东谈主员决定用苯乙烯和交联剂制造热固性团员物,它们一谈变成一种琥珀状的热固性团员物,称为交联聚苯乙烯。这种热固性材料也十分疏水,是以它不错谨防潮湿干涉并苟且DNA。为了使热固性塑料可降解,苯乙烯单体和交联剂与称为硫代内酯的单体共聚。这些联结不错通过一种叫作念半胱胺的分子来苟且。
由于苯乙烯是如斯疏水,规划东谈主员必须念念出一种步地来诱骗DNA —— 一种亲水、带负电的分子 —— 干涉苯乙烯。
为了作念到这少量,他们细目了三种单体的组合,他们不错将其振荡为团员物,通过匡助DNA与苯乙烯互相作用来熔化DNA。每一种单体皆有不同的特征,它们互相作用使DNA脱离水干涉苯乙烯。在那儿,DNA变成球形复合物,带电荷的DNA在中心,疏水性基团变成与苯乙烯互相作用的外层。当加热时,这种溶液变成固体玻璃状块,镶嵌DNA复合物。
规划东谈主员将他们的步地称为T-REX(热固性增强干燥保存)。规划东谈主员说,将DNA镶嵌团员物齐集的流程需要几个小时,但若是进一步优化,时辰可能会镌汰。
为了开释DNA,规划东谈主员领先加入半胱胺,它不错割断聚苯乙烯热固性材料的联结,将其明白成更小的碎屑。然后,不错添加一种叫作念SDS的洗涤剂,在不损坏聚苯乙烯的情况下从聚苯乙烯中去除DNA。
存储的信息
哄骗这些团员物,规划东谈主员展示了它们不错封装不同长度的DNA,从数十个核苷酸到总共这个词东谈主类基因组(超越50000个碱基对)。除了《侏罗纪公园》的主题音乐外,他们还大致存储编码《自若跟从宣言》和麻省理工学院符号的DNA。
在存储DNA然后取出后,规划东谈主员对其进行了测序,发现莫得引入失误,这是任何数字数据存储系统的重要特征。
规划东谈主员还标明,热固性团员物不错保护DNA免受高达75摄氏度(167华氏度)的高温影响。他们咫尺正在规划怎样简化制造团员物的流程,并将其变成胶囊以历久储存。
Cache DNA是一家由巴纳尔创办的公司,约翰逊是科学参谋人委员会的成员,该公司咫尺正致力于于进一步开辟DNA存储本事。他们设念念的最早的应用是为个性化医疗存储基因组,他们还展望,跟着将来更好的本事的发展,这些存储的基因组不错进行进一步的分析。
“咱们的念念法是,为什么咱们不历久保存人命的主纪录呢?”巴纳尔说。“10年或20年后,当科技的向上远远超越咱们今天的念念象时,咱们不错学到越来越多的东西。在了解基因组偏抓与疾病的关连方面,咱们仍处于起步阶段。”
这项规划是由国度科学基金会资助的。
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